国务院组成部门设立、撤销的决定程序是：

正确答案：C

花生十三讲解

关键词定位。定位关键词'国务院组成部门''设立撤销''程序'。制度常识：国务院组成部门的设立、撤销由全国人大或其常委会决定（机构改革方案经人大审议批准），机构编制法定，C正确。不是部门协商，排除A；国务院不能自行决定，排除B；不是地方申报，排除D。确认答案为C。

原解析

《宪法》第一百零九条规定，国务院各部、各委员会的设立、撤销或者合并，由总理提请全国人民代表大会常务委员会决定，这是国务院组成部门设立、撤销的法定程序。A项部门间协商、B项国务院自行审议、D项地方政府提议均不符合宪法明确规定的法定程序，因此正确答案为C。