由于农业水环境污染来源分散，而且污染物在流动过程中易呈现 、不可控性等特征，因而…

正确答案：A

【正确率 95%｜考点：实词填空】
第一空，由顿号表同义并列可知，横线处所填词语与“不可控性”构成同义并列，A项“随机性”指不设任何条件、随意的、具有一定概率的性质，B项“偶然性”指事物发展、变化中可能出现也可能不出现的情况，D项“灵活性”指具有灵活的能力，均符合文意，保留。C项“阶段性”指事物发展过程中根据一定的标准划分的段落，无法与“不可控性”构成同义并列，排除。
第二空，根据“过程拦截和末端治理均较难控制”可知，横线处所填词语应体现在流域治理上应从其他环节进行治理之意，A项“源头”指水发源的地方，侧重从发源处这一环节进行治理，符合文意，当选。B项“长效”指长期的效力，文段并未强调“效力”的时限，与文意不符，排除；D项“全局”指事物的整体及发展全过程，文段已经提到“过程拦截和末端治理均较难控制”，所以无法再从全局入手，与文意不符，排除。
故正确答案为A。
【文段出处】《加强农业面源污染防治 推动水环境质量改善》
考点实词填空词的辨析-词义侧重对应关系-前后呼应关联关系-并列关系