某食品生产企业因生产需求申请了一项行政许可，但在行政许可生效期间，其生产工艺发生…

正确答案：B

【正确率 82%｜考点：行政法】
本题考查法律常识。
A项错误，根据《行政许可法》第六十九条规定：“有下列情形之一的，作出行政许可决定的行政机关或者其上级行政机关，根据利害关系人的请求或者依据职权，可以撤销行政许可：（一）行政机关工作人员滥用职权、玩忽职守作出准予行政许可决定的；（二）超越法定职权作出准予行政许可决定的；（三）违反法定程序作出准予行政许可决定的；（四）对不具备申请资格或者不符合法定条件的申请人准予行政许可的；（五）依法可以撤销行政许可的其他情形。被许可人以欺骗、贿赂等不正当手段取得行政许可的，应当予以撤销。依照前两款的规定撤销行政许可，可能对公共利益造成重大损害的，不予撤销。依照本条第一款的规定撤销行政许可，被许可人的合法权益受到损害的，行政机关应当依法给予赔偿。依照本条第二款的规定撤销行政许可的，被许可人基于行政许可取得的利益不受保护。”题干中，该企业按照正规程序取得行政许可，不适用行政许可撤销的规定。
B项正确，D项错误，根据《行政许可法》第八条规定：“公民、法人或者其他组织依法取得的行政许可受法律保护，行政机关不得擅自改变已经生效的行政许可。行政许可所依据的法律、法规、规章修改或者废止，或者准予行政许可所依据的客观情况发生重大变化的，为了公共利益的需要，行政机关可以依法变更或者撤回已经生效的行政许可。由此给公民、法人或者其他组织造成财产损失的，行政机关应当依法给予补偿。”题干中，该企业的生产工艺发生变化，导致产生的废水超过了法定排放标准，属于客观情况发生重大变化，行政机关可以责令该企业限期改正，并可以撤回已经生效的行政许可。
C项错误，根据《行政许可法》第七十条规定：“有下列情形之一的，行政机关应当依法办理有关行政许可的注销手续：（一）行政许可有效期届满未延续的；（二）赋予公民特定资格的行政许可，该公民死亡或者丧失行为能力的；（三）法人或者其他组织依法终止的；（四）行政许可依法被撤销、撤回，或者行政许可证件依法被吊销的；（五）因不可抗力导致行政许可事项无法实施的；（六）法律、法规规定的应当注销行政许可的其他情形。”《行政许可法》没有规定行政机关可直接注销企业的行政许可。注销通常指的是在企业注销登记时，相应的行政许可失效。题干中，行政机关应当依法进行处理，如责令限期改正或撤回行政许可。
故正确答案为B。
考点行政法